Historia opowiedziana w Dragons: Dawn of New Riders rozpoczyna się w momencie, kiedy wyspa Havenholme zostaje zaatakowana przez złowrogiego Eira. Stawić mu czoła może dwójka głównych bohaterów, czyli cierpiący na amnezję badacz Scribbler oraz Patch – unikalny smok z rasy „chimeragon”, który włada nieznanymi dotąd mocami. W trakcie zabawy nie tylko staramy się uniemożliwić Eirowi schwytanie Patcha, lecz także próbujemy rozwikłać zagadkę przeszłości Scribblera i rozwinąć jego przyjaźń z Patchem.